Copper in the structure of The Crystal Structure of Plastocyanin From A Green Alga, Enteromorpha Prolifera (pdb 7pcy)

The binding sites of Copper atom in the structure of The Crystal Structure of Plastocyanin From A Green Alga, Enteromorpha Prolifera (pdb code 7pcy). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Copper atom. The 7pcy structure was solved by C.A.COLLYER, J.M.GUSS, H.C.FREEMAN, with X-Ray Crystallography technique, brief refinement statistics is given in the table below: Resolution (A) 8.4-1.8 Space group I4 a (A) 53.900 b (A) 53.900 c (A) 59.400 alpha (°) 90.00 beta (°) 90.00 gamma (°) 90.00 Rfactor (%) n/a Rfree (%) n/a Copper Binding Sites: Copper binding site 1 out of 1 in 7pcy Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Copper in the PDB 7pcy. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Copper atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Leu12, A: Gly34, A: Pro36, A: His37, A: Asn38, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, conact list: Atom Atom Distance (A) Cu HD21 A:Leu12 4.58 Cu HB3 A:Leu12 4.40 Cu O A:Gly34 4.91 Cu C A:Pro36 4.31 Cu O A:Pro36 3.50 Cu HB2 A:His37 4.51 Cu N A:His37 4.39 Cu CB A:His37 3.49 Cu HB3 A:His37 3.44 Cu CD2 A:His37 4.15 Cu C A:His37 4.77 Cu CG A:His37 3.08 Cu CA A:His37 3.61 Cu NE2 A:His37 3.98 Cu HA A:His37 2.88 Cu HE1 A:His37 2.82 Cu ND1 A:His37 1.89 Cu CE1 A:His37 2.74 Cu HE2 A:His37 4.75 Cu N A:Asn38 4.66 Cu H A:Asn38 4.00 Cu HB2 A:Cys84 3.41 Cu CB A:Cys84 3.23 Cu HB3 A:Cys84 3.19 Cu HA A:Cys84 4.97 Cu SG A:Cys84 2.12 Cu CA A:Cys84 4.61 Cu HB2 A:Pro86 3.85 Cu CB A:Pro86 4.76 Cu CG A:Pro86 4.77 Cu HD2 A:Pro86 4.46 Cu HG2 A:Pro86 4.38 Cu HB2 A:His87 2.86 Cu N A:His87 4.40 Cu CB A:His87 3.47 Cu HB3 A:His87 3.90 Cu CD2 A:His87 4.31 Cu CG A:His87 3.18 Cu CA A:His87 4.64 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.33 Cu ND1 A:His87 2.17 Cu H A:His87 3.86 Cu CE1 A:His87 3.12 Cu HB2 A:Met92 4.78 Cu HG3 A:Met92 4.92 Cu CB A:Met92 4.71 Cu HB3 A:Met92 4.33 Cu HE3 A:Met92 3.38 Cu CG A:Met92 4.15 Cu SD A:Met92 2.92 Cu HG2 A:Met92 3.92 Cu CE A:Met92 3.49 Cu HE1 A:Met92 4.43 Cu HE2 A:Met92 3.38 interactive model: