Copper in the structure of A Joint Neutron and X-Ray Structure of Oxidized Amicyanin (pdb 3l45)

The binding sites of Copper atom in the structure of A Joint Neutron and X-Ray Structure of Oxidized Amicyanin (pdb code 3l45). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Copper atom. The 3l45 structure was solved by N.SUKUMAR, F.S.MATHEWS, P.LANGAN, V.L.DAVIDSON, with X-Ray Crystallography technique, brief refinement statistics is given in the table below: Resolution (A) 1.8 Space group P1211 a (A) 27.540 b (A) 56.580 c (A) 28.860 alpha (°) 90.00 beta (°) 96.21 gamma (°) 90.00 Rfactor (%) 19.8 Rfree (%) 21.5 Copper Binding Sites: Copper binding site 1 out of 1 in 3l45 Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Copper in the PDB 3l45. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Copper atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Ile25, A: Met28, A: Met51, A: Pro52, A: His53, A: Asn54, A: Met71, A: Cys92, A: Pro94, A: His95, A: Met98, conact list: Atom Atom Distance (A) Cu HG23 A:Ile25 4.94 Cu HE2 A:Met28 4.19 Cu HG3 A:Met51 4.85 Cu C A:Pro52 4.81 Cu O A:Pro52 4.10 Cu HB2 A:His53 4.39 Cu N A:His53 4.70 Cu CB A:His53 3.35 Cu HB3 A:His53 2.89 Cu CD2 A:His53 4.15 Cu C A:His53 4.67 Cu CG A:His53 3.03 Cu CA A:His53 3.68 Cu NE2 A:His53 4.10 Cu HA A:His53 2.99 Cu HE1 A:His53 3.23 Cu ND1 A:His53 2.03 Cu CE1 A:His53 2.98 Cu DE2 A:His53 5.00 Cu HE2 A:His53 5.00 Cu N A:Asn54 4.51 Cu H A:Asn54 3.69 Cu HE1 A:Met71 4.91 Cu HB2 A:Cys92 3.18 Cu HG A:Cys92 2.80 Cu CB A:Cys92 3.12 Cu HB3 A:Cys92 3.27 Cu HA A:Cys92 4.85 Cu SG A:Cys92 2.11 Cu DG A:Cys92 2.80 Cu CA A:Cys92 4.52 Cu HG3 A:Pro94 4.89 Cu CG A:Pro94 4.53 Cu HD2 A:Pro94 4.46 Cu HG2 A:Pro94 3.54 Cu HB2 A:His95 2.83 Cu N A:His95 4.60 Cu CB A:His95 3.64 Cu HB3 A:His95 4.26 Cu CD2 A:His95 4.49 Cu CG A:His95 3.37 Cu CA A:His95 4.72 Cu O A:His95 4.83 Cu NE2 A:His95 4.41 Cu HE1 A:His95 3.37 Cu ND1 A:His95 2.37 Cu H A:His95 4.12 Cu D A:His95 4.12 Cu CE1 A:His95 3.26 Cu HB2 A:Met98 4.24 Cu HG3 A:Met98 4.49 Cu CB A:Met98 4.79 Cu HE3 A:Met98 4.62 Cu CG A:Met98 4.37 Cu SD A:Met98 2.84 Cu CE A:Met98 3.63 Cu HE1 A:Met98 3.41 Cu HE2 A:Met98 3.91 interactive model: