Copper in the structure of The Complex Of Cytochrome F And Plastocyanin Determined With Paramagnetic uc(Nmr). Based on the Structures of Cytochrome F and Plastocyanin, 10 Structures (pdb 2pcf)

The binding sites of Copper atom in the structure of The Complex Of Cytochrome F And Plastocyanin Determined With Paramagnetic uc(Nmr). Based on the Structures of Cytochrome F and Plastocyanin, 10 Structures (pdb code 2pcf). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Copper atom. The 2pcf structure was solved by M.UBBINK, M.EJDEBACK, B.G.KARLSSON, D.S.BENDALL, with NMR in Solution technique. Copper Binding Sites: Copper binding site 1 out of 1 in 2pcf Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Copper in the PDB 2pcf. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Copper atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Leu12, A: Gly34, A: Phe35, A: Pro36, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, A: Leu5, A: Leu12, A: Gly34, A: Phe35, A: Pro36, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, A: Leu12, A: Gly34, A: Pro36, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, A: Leu5, A: Leu12, A: Gly34, A: Phe35, A: Pro36, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, A: Leu5, A: Leu12, A: Gly34, A: Phe35, A: Pro36, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, A: Leu12, A: Gly34, A: Pro36, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, A: Leu5, A: Leu12, A: Gly34, A: Phe35, A: Pro36, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, A: Leu5, A: Leu12, A: Gly34, A: Phe35, A: Pro36, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, A: Leu12, A: Gly34, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Ala90, A: Met92, A: Leu12, A: Gly34, A: Pro36, A: His37, A: Cys84, A: Pro86, A: His87, A: Met92, conact list: Atom Atom Distance (A) Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu HA A:Phe35 4.96 Cu C A:Pro36 4.38 Cu O A:Pro36 3.32 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu HA A:Phe35 4.96 Cu C A:Pro36 4.38 Cu O A:Pro36 3.32 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu C A:Pro36 4.38 Cu O A:Pro36 3.32 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu HA A:Phe35 4.96 Cu C A:Pro36 4.38 Cu O A:Pro36 3.32 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu HA A:Phe35 4.96 Cu C A:Pro36 4.38 Cu O A:Pro36 3.32 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu C A:Pro36 4.38 Cu O A:Pro36 3.32 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu HA A:Phe35 4.96 Cu C A:Pro36 4.38 Cu O A:Pro36 3.32 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu HA A:Phe35 4.96 Cu C A:Pro36 4.38 Cu O A:Pro36 3.32 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 Cu HD21 A:Leu12 3.33 Cu HD22 A:Leu12 4.66 Cu HB3 A:Leu12 4.05 Cu CD2 A:Leu12 4.38 Cu HD23 A:Leu12 4.87 Cu O A:Gly34 3.82 Cu C A:Gly34 4.97 Cu C A:Pro36 4.38 Cu O A:Pro36 3.32 Cu N A:His37 4.80 Cu CB A:His37 4.53 Cu HB3 A:His37 4.93 Cu CD2 A:His37 4.22 Cu CG A:His37 3.64 Cu CA A:His37 4.22 Cu NE2 A:His37 3.71 Cu HA A:His37 3.26 Cu HE1 A:His37 2.35 Cu ND1 A:His37 2.45 Cu CE1 A:His37 2.56 Cu HE2 A:His37 4.05 Cu HB2 A:Cys84 4.29 Cu CB A:Cys84 3.97 Cu HB3 A:Cys84 4.04 Cu SG A:Cys84 2.61 Cu HB2 A:Pro86 3.89 Cu HG3 A:Pro86 4.84 Cu CB A:Pro86 4.46 Cu CD A:Pro86 4.86 Cu C A:Pro86 4.13 Cu CG A:Pro86 4.13 Cu CA A:Pro86 4.85 Cu HD2 A:Pro86 4.52 Cu HG2 A:Pro86 3.13 Cu O A:Pro86 3.88 Cu HB2 A:His87 2.52 Cu N A:His87 4.37 Cu CB A:His87 3.22 Cu HB3 A:His87 3.80 Cu CD2 A:His87 4.07 Cu CG A:His87 3.02 Cu CA A:His87 4.42 Cu HD2 A:His87 4.94 Cu NE2 A:His87 4.26 Cu HE1 A:His87 3.75 Cu ND1 A:His87 2.42 Cu H A:His87 4.92 Cu CE1 A:His87 3.37 Cu HE3 A:Met92 4.47 Cu CG A:Met92 4.70 Cu SD A:Met92 3.22 Cu HG2 A:Met92 4.66 Cu CE A:Met92 4.37 Cu HE2 A:Met92 4.41 interactive model: