Copper in the structure of Solution Structure of Cui-DR1885 From Deinococcus Radiodurans (pdb 1x9l)

The binding sites of Copper atom in the structure of Solution Structure of Cui-DR1885 From Deinococcus Radiodurans (pdb code 1x9l). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Copper atom. The 1x9l structure was solved by L.BANCI, I.BERTINI, S.CIOFI-BAFFONI, E.KATSARI, N.KATSAROS, K.KUBICEK, STRUCTURAL PROTEOMICS IN EUROPE (SPINE), with NMR in Solution technique. Copper Binding Sites: Copper binding site 1 out of 1 in 1x9l Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Copper in the PDB 1x9l. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Copper atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Met75, A: Met86, A: Arg104, A: Asp105, A: His108, A: Met110, A: Thr50, A: Leu51, A: Thr99, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Met75, A: Thr76, A: Thr77, A: Thr78, A: Met86, A: Leu102, A: Gln103, A: Asp105, A: Gly106, A: Asp107, A: His108, A: Tyr48, A: Met49, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Arg104, A: Gly106, A: Asp107, A: His108, A: Val30, A: Gln31, A: Met49, A: Thr50, A: Leu51, A: Thr52, A: Met75, A: Thr76, A: Thr77, A: Met86, A: Leu92, A: Gln103, A: Gly106, A: Asp107, A: His108, A: Met49, A: Thr50, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Gly106, A: Asp107, A: Gln31, A: Met49, A: Thr50, A: Leu51, A: Thr52, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Met75, A: Met86, A: Arg104, A: His108, A: Met110, A: Val30, A: Gln31, A: Gly32, A: Ile126, A: Leu136, A: Asn137, A: Val138, A: Ala139, A: Thr78, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Gly106, A: Asp107, A: Met49, A: Thr50, A: Leu51, A: Thr99, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Thr78, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Gly106, A: Asp107, A: Thr76, A: Thr77, A: Gly82, A: Leu92, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Gly106, A: Asp107, A: His108, A: Tyr48, A: Met49, A: Thr50, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Leu74, A: Met75, A: Thr76, A: Met86, A: Asp107, A: His108, A: Val109, A: Met110, A: Met49, A: Thr50, A: Leu51, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Thr78, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Gly106, A: Asp107, A: His108, A: Met75, A: Thr76, A: Met86, A: Gln103, A: Arg104, A: Asp105, A: Gly106, A: Asp107, A: His108, A: Met110, A: Thr76, A: Thr77, A: Thr78, A: Gly81, A: Leu100, A: Thr101, A: Leu102, A: Gln103, A: Gly106, A: Asp107, A: His108, conact list: Atom Atom Distance (A) Cu HB2 A:Met75 3.87 Cu HG3 A:Met75 4.24 Cu CB A:Met75 3.79 Cu HB3 A:Met75 3.55 Cu HE3 A:Met75 4.52 Cu CG A:Met75 3.27 Cu SD A:Met75 2.44 Cu HG2 A:Met75 3.21 Cu CE A:Met75 3.60 Cu HE1 A:Met75 3.59 Cu HE2 A:Met75 3.95 Cu HG3 A:Met86 4.19 Cu CB A:Met86 4.79 Cu HE3 A:Met86 3.03 Cu C A:Met86 4.96 Cu CG A:Met86 3.57 Cu SD A:Met86 2.50 Cu HG2 A:Met86 3.34 Cu O A:Met86 4.78 Cu CE A:Met86 3.11 Cu HA A:Met86 4.78 Cu HE1 A:Met86 4.16 Cu HE2 A:Met86 3.21 Cu O A:Arg104 4.31 Cu HA A:Asp105 4.95 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 Cu HB2 A:Met110 4.90 Cu HG3 A:Met110 2.95 Cu CB A:Met110 4.58 Cu HE3 A:Met110 3.82 Cu CG A:Met110 3.10 Cu SD A:Met110 2.41 Cu HG2 A:Met110 3.23 Cu CE A:Met110 3.48 Cu HE1 A:Met110 4.43 Cu HE2 A:Met110 3.42 Cu HB2 A:Met75 3.87 Cu HG3 A:Met75 4.24 Cu CB A:Met75 3.79 Cu HB3 A:Met75 3.55 Cu HE3 A:Met75 4.52 Cu CG A:Met75 3.27 Cu SD A:Met75 2.44 Cu HG2 A:Met75 3.21 Cu CE A:Met75 3.60 Cu HE1 A:Met75 3.59 Cu HE2 A:Met75 3.95 Cu HG3 A:Met86 4.19 Cu CB A:Met86 4.79 Cu HE3 A:Met86 3.03 Cu C A:Met86 4.96 Cu CG A:Met86 3.57 Cu SD A:Met86 2.50 Cu HG2 A:Met86 3.34 Cu O A:Met86 4.78 Cu CE A:Met86 3.11 Cu HA A:Met86 4.78 Cu HE1 A:Met86 4.16 Cu HE2 A:Met86 3.21 Cu HA A:Asp105 4.95 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 Cu O A:Arg104 4.31 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 Cu HB2 A:Met75 3.87 Cu HG3 A:Met75 4.24 Cu CB A:Met75 3.79 Cu HB3 A:Met75 3.55 Cu HE3 A:Met75 4.52 Cu CG A:Met75 3.27 Cu SD A:Met75 2.44 Cu HG2 A:Met75 3.21 Cu CE A:Met75 3.60 Cu HE1 A:Met75 3.59 Cu HE2 A:Met75 3.95 Cu HG3 A:Met86 4.19 Cu CB A:Met86 4.79 Cu HE3 A:Met86 3.03 Cu C A:Met86 4.96 Cu CG A:Met86 3.57 Cu SD A:Met86 2.50 Cu HG2 A:Met86 3.34 Cu O A:Met86 4.78 Cu CE A:Met86 3.11 Cu HA A:Met86 4.78 Cu HE1 A:Met86 4.16 Cu HE2 A:Met86 3.21 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 Cu HB2 A:Met75 3.87 Cu HG3 A:Met75 4.24 Cu CB A:Met75 3.79 Cu HB3 A:Met75 3.55 Cu HE3 A:Met75 4.52 Cu CG A:Met75 3.27 Cu SD A:Met75 2.44 Cu HG2 A:Met75 3.21 Cu CE A:Met75 3.60 Cu HE1 A:Met75 3.59 Cu HE2 A:Met75 3.95 Cu HG3 A:Met86 4.19 Cu CB A:Met86 4.79 Cu HE3 A:Met86 3.03 Cu C A:Met86 4.96 Cu CG A:Met86 3.57 Cu SD A:Met86 2.50 Cu HG2 A:Met86 3.34 Cu O A:Met86 4.78 Cu CE A:Met86 3.11 Cu HA A:Met86 4.78 Cu HE1 A:Met86 4.16 Cu HE2 A:Met86 3.21 Cu O A:Arg104 4.31 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 Cu HB2 A:Met110 4.90 Cu HG3 A:Met110 2.95 Cu CB A:Met110 4.58 Cu HE3 A:Met110 3.82 Cu CG A:Met110 3.10 Cu SD A:Met110 2.41 Cu HG2 A:Met110 3.23 Cu CE A:Met110 3.48 Cu HE1 A:Met110 4.43 Cu HE2 A:Met110 3.42 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 Cu HB2 A:Met75 3.87 Cu HG3 A:Met75 4.24 Cu CB A:Met75 3.79 Cu HB3 A:Met75 3.55 Cu HE3 A:Met75 4.52 Cu CG A:Met75 3.27 Cu SD A:Met75 2.44 Cu HG2 A:Met75 3.21 Cu CE A:Met75 3.60 Cu HE1 A:Met75 3.59 Cu HE2 A:Met75 3.95 Cu HG3 A:Met86 4.19 Cu CB A:Met86 4.79 Cu HE3 A:Met86 3.03 Cu C A:Met86 4.96 Cu CG A:Met86 3.57 Cu SD A:Met86 2.50 Cu HG2 A:Met86 3.34 Cu O A:Met86 4.78 Cu CE A:Met86 3.11 Cu HA A:Met86 4.78 Cu HE1 A:Met86 4.16 Cu HE2 A:Met86 3.21 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 Cu HB2 A:Met110 4.90 Cu HG3 A:Met110 2.95 Cu CB A:Met110 4.58 Cu HE3 A:Met110 3.82 Cu CG A:Met110 3.10 Cu SD A:Met110 2.41 Cu HG2 A:Met110 3.23 Cu CE A:Met110 3.48 Cu HE1 A:Met110 4.43 Cu HE2 A:Met110 3.42 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 Cu HB2 A:Met75 3.87 Cu HG3 A:Met75 4.24 Cu CB A:Met75 3.79 Cu HB3 A:Met75 3.55 Cu HE3 A:Met75 4.52 Cu CG A:Met75 3.27 Cu SD A:Met75 2.44 Cu HG2 A:Met75 3.21 Cu CE A:Met75 3.60 Cu HE1 A:Met75 3.59 Cu HE2 A:Met75 3.95 Cu HG3 A:Met86 4.19 Cu CB A:Met86 4.79 Cu HE3 A:Met86 3.03 Cu C A:Met86 4.96 Cu CG A:Met86 3.57 Cu SD A:Met86 2.50 Cu HG2 A:Met86 3.34 Cu O A:Met86 4.78 Cu CE A:Met86 3.11 Cu HA A:Met86 4.78 Cu HE1 A:Met86 4.16 Cu HE2 A:Met86 3.21 Cu O A:Arg104 4.31 Cu HA A:Asp105 4.95 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 Cu HB2 A:Met110 4.90 Cu HG3 A:Met110 2.95 Cu CB A:Met110 4.58 Cu HE3 A:Met110 3.82 Cu CG A:Met110 3.10 Cu SD A:Met110 2.41 Cu HG2 A:Met110 3.23 Cu CE A:Met110 3.48 Cu HE1 A:Met110 4.43 Cu HE2 A:Met110 3.42 Cu CD2 A:His108 3.39 Cu HD1 A:His108 4.95 Cu CG A:His108 4.38 Cu HD2 A:His108 3.85 Cu NE2 A:His108 2.15 Cu HE1 A:His108 2.93 Cu ND1 A:His108 4.13 Cu CE1 A:His108 2.88 interactive model: