Copper in the structure of Solution Structure of Reduced Cu(I) Plastocyanin From Synechocystis PCC6803 (pdb 1jxd)

The binding sites of Copper atom in the structure of Solution Structure of Reduced Cu(I) Plastocyanin From Synechocystis PCC6803 (pdb code 1jxd). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Copper atom. The 1jxd structure was solved by I.BERTINI, D.A.BRYANT, S.CIURLI, A.DIKIY, C.O.FERNANDEZ, C.LUCHINAT, N.SAFAROV, A.J.VILA, J.ZHAO, with NMR in Solution technique. Copper Binding Sites: Copper binding site 1 out of 1 in 1jxd Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Copper in the PDB 1jxd. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Copper atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Leu14, A: Phe16, A: Pro38, A: His39, A: Asn40, A: Cys83, A: Pro85, A: His86, A: Met91, conact list: Atom Atom Distance (A) Cu HB2 A:Leu14 4.37 Cu CD1 A:Leu14 4.50 Cu HD11 A:Leu14 3.90 Cu HD13 A:Leu14 4.05 Cu HZ A:Phe16 4.92 Cu C A:Pro38 4.87 Cu O A:Pro38 4.09 Cu HB2 A:His39 4.69 Cu N A:His39 4.82 Cu CB A:His39 3.65 Cu HB3 A:His39 3.34 Cu CD2 A:His39 4.33 Cu CG A:His39 3.20 Cu CA A:His39 3.99 Cu NE2 A:His39 4.27 Cu HA A:His39 3.32 Cu HE1 A:His39 3.34 Cu ND1 A:His39 2.15 Cu CE1 A:His39 3.13 Cu H A:Asn40 4.46 Cu HB2 A:Cys83 2.92 Cu CB A:Cys83 3.07 Cu HB3 A:Cys83 3.32 Cu HA A:Cys83 4.68 Cu SG A:Cys83 2.29 Cu CA A:Cys83 4.49 Cu HG3 A:Pro85 4.98 Cu CG A:Pro85 4.63 Cu HD2 A:Pro85 4.74 Cu HG2 A:Pro85 3.57 Cu HB2 A:His86 2.94 Cu N A:His86 4.50 Cu CB A:His86 3.58 Cu HB3 A:His86 4.28 Cu CD2 A:His86 4.28 Cu CG A:His86 3.16 Cu CA A:His86 4.66 Cu NE2 A:His86 4.24 Cu HE1 A:His86 3.32 Cu ND1 A:His86 2.12 Cu H A:His86 3.70 Cu CE1 A:His86 3.10 Cu HG3 A:Met91 4.85 Cu CB A:Met91 4.90 Cu HB3 A:Met91 4.39 Cu HE3 A:Met91 4.36 Cu CG A:Met91 4.43 Cu SD A:Met91 2.82 Cu CE A:Met91 3.90 Cu HE1 A:Met91 3.68 Cu HE2 A:Met91 4.79 interactive model: