Copper in the structure of Solution Structure of Oxidized Paramagnetic Cu(II) Plastocyanin From Synechocystis PCC6803-Minimized Average Structure (pdb 1j5d)

The binding sites of Copper atom in the structure of Solution Structure of Oxidized Paramagnetic Cu(II) Plastocyanin From Synechocystis PCC6803-Minimized Average Structure (pdb code 1j5d). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Copper atom. The 1j5d structure was solved by I.BERTINI, S.CIURLI, A.DIKIY, C.O.FERNANDEZ, C.LUCHINAT, N.SAFAROV, S.SHUMILIN, A.J.VILA, with NMR in Solution technique. Copper Binding Sites: Copper binding site 1 out of 1 in 1j5d Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Copper in the PDB 1j5d. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Copper atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Met7, A: Phe16, A: Leu36, A: Pro38, A: His39, A: Asn40, A: Cys83, A: His86, A: Met91, conact list: Atom Atom Distance (A) Cu HB3 A:Met7 4.81 Cu HE1 A:Phe16 3.68 Cu CE1 A:Phe16 4.75 Cu O A:Leu36 4.89 Cu O A:Pro38 4.44 Cu HB2 A:His39 4.87 Cu N A:His39 4.89 Cu CB A:His39 3.79 Cu HB3 A:His39 3.67 Cu CD2 A:His39 4.38 Cu C A:His39 4.83 Cu CG A:His39 3.29 Cu CA A:His39 3.89 Cu NE2 A:His39 4.32 Cu HA A:His39 3.04 Cu HE1 A:His39 3.43 Cu ND1 A:His39 2.25 Cu CE1 A:His39 3.20 Cu N A:Asn40 4.58 Cu O A:Asn40 4.24 Cu H A:Asn40 3.70 Cu O A:Cys83 4.94 Cu HB2 A:Cys83 3.30 Cu CB A:Cys83 3.22 Cu HB3 A:Cys83 3.24 Cu HA A:Cys83 4.92 Cu SG A:Cys83 2.34 Cu CA A:Cys83 4.66 Cu HB2 A:His86 3.31 Cu CB A:His86 3.55 Cu HB3 A:His86 3.47 Cu CD2 A:His86 4.28 Cu CG A:His86 3.17 Cu NE2 A:His86 4.25 Cu HE1 A:His86 3.38 Cu ND1 A:His86 2.17 Cu CE1 A:His86 3.14 Cu HB2 A:Met91 4.76 Cu HG3 A:Met91 4.69 Cu CB A:Met91 4.79 Cu HB3 A:Met91 4.49 Cu HE3 A:Met91 4.19 Cu CG A:Met91 4.28 Cu SD A:Met91 2.66 Cu HG2 A:Met91 4.99 Cu CE A:Met91 3.34 Cu HE1 A:Met91 2.92 Cu HE2 A:Met91 3.89 interactive model: